Фамилия Лиманько — характерный пример восточнославянской фамилии, образованной по украинской модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, самый распространённый в украинской ономастике, изначально означал «маленький» или «сын»: Лиманько — буквально «сын Лиманя» или «малый Лимань». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, украинские фамилии на -енко не склоняются в мужском роде и указывают на происхождение с территории современной Украины или южных регионов России, где исторически была сильна украинская колонизация.

Основа фамилии — Лимань — скорее всего, прозвище, а не крестильное имя. В украинском языке «лиман» — это не только географический термин (залив в устье реки, часто встречающийся в Причерноморье и Приазовье), но и диалектное слово, обозначающее болото, топь или заливной луг. Прозвище Лимань могли дать человеку, жившему у такого водоёма, или тому, кто отличался медлительностью, «вязкостью» характера. Вторая версия, менее вероятная, связывает основу с тюркским словом «лиман» (гавань) — в таком случае прозвище могло принадлежать рыбаку или лодочнику на морском побережье.

География фамилии подтверждает её южнорусское и украинское происхождение. Наибольшая концентрация носителей Лиманько фиксируется в Краснодарском крае и Ростовской области — регионах, активно заселявшихся запорожскими казаками и крестьянами из Малороссии в XVIII–XIX веках. Встречается фамилия и в центральных областях Украины, особенно в Черкасской и Полтавской, где топоним «Лиман» распространён в названиях сёл.

С точки зрения социального статуса, фамилия Лиманько не указывает на дворянское происхождение: суффикс -енко в малороссийской среде был типичен для казачьих и крестьянских родов. В реестрах запорожского войска XVII–XVIII веков часто встречаются прозвища, образованные от местности, что делает версию о происхождении от географического объекта наиболее правдоподобной. Фамилия не имеет отношения к личным именам вроде Лиман (которых в святцах не было) — это стопроцентно прозвищная основа.