Фамилия Липцов — одна из тех, что образована не напрямую от имени или профессии, а через прозвище, которое успело обрасти суффиксом до того, как превратилось в фамилию. Основа здесь — «Липец», а не «Лип». Суффикс -ец указывает на человека, связанного с местом или предметом: липец — это либо житель города Липецка (или села Липцы), либо человек, живший у липовой рощи. Второй вариант встречается чаще, так как в XVI–XVII веках прозвища по месту жительства давали именно по характерным природным объектам.

Словообразовательная модель проста: к основе «Липец» добавили патронимический суффикс -ов, получив «Липцов» — «сын Липца». Фамилия закрепилась в центральных и южнорусских губерниях, особенно в Тамбовской и Рязанской областях, где липовые леса были обычным ландшафтом. В этих местах прозвище «Липец» могло означать человека, жившего на «липцах» — так называли вырубки или поляны среди лип.

Интересная деталь: в отличие от фамилий Липкин или Липов, где корень указывает на дерево напрямую, Липцов сохраняет промежуточную ступень. Это говорит о том, что предок носителя был известен не просто как «липовый человек», а как конкретный Липец — возможно, крестьянин, получивший прозвище от односельчан за то, что его двор стоял на липовой поляне. В писцовых книгах XVII века встречаются записи о крестьянах с таким именованием, но массово фамилия Липцов стала фиксироваться только после отмены крепостного права, когда бывшим крепостным давали фамилии по прозвищам.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на первый слог — Ли́пцов, хотя в некоторых говорах может смещаться на окончание. Спорных версий происхождения здесь нет: корень прозрачен, а альтернативные гипотезы (например, от литовского lipa — «липа» или от польского lipiec — «июль») не подтверждаются географией распространения фамилии, которая остаётся сугубо русской.