Фамилия Липунов — одна из тех, где за привычным звучанием скрывается неожиданная глубина. В её основе лежит прозвище Липун, и тут есть над чем задуматься.

Самая распространённая версия отсылает к дереву липе. Для восточных и западных славян липа была не просто деревом. В народном христианстве она считалась деревом Богородицы: по преданиям, именно липа укрыла Марию с младенцем Христом во время бегства в Египет, а на её ветвях чаще всего «являлись» чудотворные иконы. На липу вешали образки, с ней связывали защиту от болезней — в ствол забивали одежду больного, а дымом от сожжённой древесины окуривали людей и скот. Вполне вероятно, что прозвище Липун носило «охранительный» характер: родители надеялись, что имя-оберег убережёт ребёнка от злых сил. Есть и другая, менее убедительная версия — от глагола «липнуть» в значении «приставать, донимать», но она проигрывает первой по смысловой наполненности.

Модель образования фамилии типична для русского Северо-Востока и центральных областей: суффикс -ов указывает на принадлежность: Липунов — сын Липуна. Менее известный факт: Липуновы — не просто крестьянский или мещанский род. Существует дворянская ветвь, которая выводит своё происхождение от Рюриковичей. Речь идёт о князьях Мерьских-Галичей — младшей ветви потомства Владимира Мономаха, а точнее, великого князя Всеволода Юрьевича Большое Гнездо. Это делает фамилию одной из тех, где за крестьянским прозвищем может стоять древняя аристократическая линия.

Среди современных носителей наиболее известен Владимир Михайлович Липунов — профессор МГУ имени Ломоносова, соросовский профессор, член Союза писателей России, главный редактор литературного интернет-журнала «Русский переплёт». Он — автор книг, монографий и учебных пособий, лауреат Ломоносовской премии 2004 года.