Основой фамилии Лишков послужило мирское имя Лешак. Возможно, фамилия Лишков восходит к наречию «лишку», т.е. больше, чем нужно; излишне много. Согласно другой версии, эта фамилия является фонетическим вариантом фамилии Лешков. В свою очередь, она могла быть образована от нецерковного имени Лешка, восходящего к мужским именам Александр (в переводе с греческого – «защитник людей»), Алексей («защитник») или Илья («божья сила»). Однако более вероятно, что эта фамилия образована от «охранительного» имени Леший, точнее от его просторечной формы Лешак. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лешак, со временем получил фамилию Лишков.