Фамилия Лишненко — яркий пример украинской модели образования фамилий. Суффикс -енко, характерный для Поднепровья и Левобережной Украины (территории бывшей Гетманщины), означает «маленький», «сын» или «потомок». То есть Лишненко — это буквально «сын Лишнего» или «потомок Лишнего». Вопрос в том, кого в XVII–XVIII веках прозвали Лишним.

Самое простое и правдоподобное объяснение лежит на поверхности: прозвище Лишний давали человеку, который был «лишним» в семье, то есть родился, когда детей уже было достаточно, или был нежеланным, «сверх счета». В крестьянском быту, где каждый рот был на учете, такое прозвище могло закрепиться за младшим сыном или поздним ребенком. Однако не стоит приписывать ему обидный оттенок — в среде, где имена-обереги (Некрас, Неждан, Лишний) были нормой, прозвище могло защищать от сглаза.

Вторая, менее очевидная версия, связана с профессиональной или социальной характеристикой. «Лишним» могли назвать человека, который оставался без дела, «лишнего» в артели, или же, наоборот, того, кто брал на себя лишнюю работу. В некоторых говорах «лишний» означал «посторонний», «чужак» — так могли прозвать пришлого человека, который осел в селе, но не вписался в общину.

Фамилия Лишненко — довольно редкая и компактная. В отличие от распространенных Коваленко или Шевченко, она не разошлась широко, что указывает на локальное происхождение. Вероятнее всего, предки носителей этой фамилии жили в одном из сел Полтавщины или Черниговщины, где и возникло прозвище. Сейчас фамилия встречается в основном в Украине и в южных регионах России, куда переселялись украинские крестьяне в XIX веке. Форма без суффикса -ский и без дворянской приставки четко указывает на казацкое или крестьянское происхождение рода.