Фамилия Лисовский в подавляющем большинстве случаев — типичная «топонимическая» фамилия. Её получил человек, чьи предки жили в селе или местечке с названием Лисово, Лисова, Лисовка. Таких топонимов немало на территории современных Польши, Беларуси и Западной Украины, что указывает на западное или юго-западное происхождение фамилии. Суффикс -ский в польской и украинской традиции как раз и служил для обозначения связи с местом: «Лисовский» — выходец из Лисова.

Однако корень «лис» мог иметь и другое значение, не связанное с животным. Слово «лисый» в старых русских говорах означало «желтый», «рыжеватый» или «плешивый». Поэтому прозвище Лис могло относиться к человеку с рыжими волосами или, наоборот, с залысинами. Эта версия более правдоподобна, чем попытка вывести фамилию из сокращённых форм крестильных имён (Алексей, Алипий) с утратой начального «а» — например, от Алисов, Алисовский. Такое объяснение выглядит натянутым и не находит подтверждения в массовом бытовании фамилии.

В польской ономастике фамилия Лисовский встречается часто и однозначно связывается с прозвищем Lis (лис), которое давали хитрому или рыжему человеку. В русской среде фамилия могла быть принесена переселенцами из Речи Посполитой или появиться самостоятельно в южных и западных губерниях Российской империи. Дворянские роды Лисовских известны с XVI века, но подавляющее большинство носителей фамилии — потомки крестьян и мещан, получивших фамилию по месту жительства.