Фамилия Листратенкова — вариант женского рода от Листратенков, а та, в свою очередь, образована по характерной для юга России и Украины модели: от прозвища или имени с помощью суффикса -енко, который со временем оброс дополнительным -ов. Такие «двойные» фамилии (Листратенко → Листратенков) возникали, когда носитель переселялся в великорусские губернии, где патронимический суффикс -ов требовала местная административная традиция, или же при русификации документа.

Основа — Листрат. Это просторечная, народная форма крестильного имени Каллистрат (от греческого «прекрасный воин»). В русских говорах имя упрощалось: начальный слог «Кал-» отпадал, и получалось Листрат. Уменьшительные варианты — Листратка, Листратенок. Последнее, «Листратенок», и стало прямым источником фамилии: так могли называть сына или младшего родственника человека по имени Листрат. Суффикс -енок в восточнославянских фамилиях куда реже, чем -енко, и указывает скорее на северные или центральные области России, где -енок было типичным патронимическим показателем (сравните: Волчонок, Козлёнок). Однако финальное -ков (Листратенков) выдает уже более позднее оформление по общерусскому образцу.

Встречаются однокоренные фамилии: Листратов, Листратенко, Листраткин. Вариант Листратенкова географически чаще привязан к Курской, Белгородской и Воронежской областям — зоне перехода украинской фамильной системы в русскую. По сословию предки могли быть как крестьянами, так и однодворцами, но точных данных без генеалогического поиска нет.

В написании фамилии возможна путаница: в документах XIX века встречается и Листратенков, и Листратенковъ, а в устной речи ударение обычно падает на второй слог: Листра́тенкова.