Фамилия Лисукова — женская форма, а её мужской вариант Лисуков. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Лисук. Модель образования проста: к основе Лисук добавили типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Лисуков, то есть сын или потомок Лисука). Суффикс -ук в прозвищах характерен для западных и южных русских земель, особенно для Украины и Белоруссии, где он выполнял уменьшительную или уничижительную функцию. Таким образом, Лисук — это «маленький лис» или «лисёнок», но в переносном смысле, скорее всего, хитрый, льстивый или рыжий человек.

Корень «лис» в русских прозвищах и фамилиях один из самых распространённых, но именно с суффиксом -ук он встречается реже, чем, например, Лисов или Лисицын. Это сразу выделяет фамилию из общего ряда. Прямой параллели с названием животного здесь не стоит переоценивать: в старину прозвища давали не столько за внешнее сходство, сколько за поведение. Лисуком могли назвать пронырливого торговца, умелого переговорщика или человека с «лисьим» — узким и хитрым — лицом.

Географически фамилия Лисуков (и Лисукова) тяготеет к южнорусским областям и восточной Украине. В документах XVII–XVIII веков, например, в реестрах Войска Запорожского, встречаются казаки с прозвищем Лисук, но в фамилию оно оформилось уже позже, после отмены крепостного права, когда большинство крестьян получили официальные фамилии. Сословно носители фамилии — в основном бывшие крестьяне или однодворцы, реже — мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что говорит о её «народном», низовом происхождении.

С точки зрения ударения, в фамилии Лисукова оно обычно падает на второй слог: Лису́кова. Это соответствует общему правилу для фамилий на -уков, где суффикс часто бывает ударным. Встречающийся изредка вариант с ударением на первый слог (Ли́сукова) — скорее исключение, связанное с местным говором.