Фамилия Лизанец образована от прозвища Лизан. В основе лежит глагол «лизать», и в старину Лизаном называли хитроватых, льстивых людей — тех, кто умел «подлизаться». Однако у этого прозвища есть и вторая, менее очевидная версия: оно могло быть связано с именем духа Лизуна, который по поверьям обитал за печкой или в подполье. В этом случае прозвище выполняло охранительную функцию — родители нарекали сына Лизаном, чтобы отпугнуть нечистую силу, а сам ребёнок, по замыслу, вырастал здоровым и красивым.

Модель образования фамилии проста: к основе Лизан добавился типичный для украинских и южнорусских фамилий суффикс -ец, указывающий на принадлежность или происхождение («сын Лизана»). В отличие от фамилий на -ов или -ин, которые чаще встречаются в северных и центральных регионах, суффикс -ец характерен для западнорусских и украинских земель. Поэтому географически фамилия Лизанец скорее всего бытовала в чернозёмных губерниях или на территории современной Украины.

С течением времени прозвище Лизан, первоначально бытовое, полностью вытеснило крестильное имя и закрепилось в документах как наследственное, дав начало фамилии Лизанец.