Фамилия Лизунов образована от прозвища Лизун. Оно, в свою очередь, происходит от нарицательного «лизун». Менее вероятно, что фамилия Лизунов восходит к мирскому имени Лизун, просторечной форме крестильного имени Елизар (старинное – Елиазар). В переводе с древнееврейского оно означает «Бог помог». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Лизун, со временем получил фамилию Лизунов.