Фамилия Ломаненко — характерный пример восточноукраинской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, буквально означающий «маленький» или «сын», в XVI–XVII веках закрепился на Левобережной и Слободской Украине как основной способ образования фамилий от прозвищ и профессий. Ломаненко — буквально «сын Ломаного».

Ключевой вопрос — что стояло за прозвищем Ломаный. Самая вероятная версия отсылает к диалектному слову «ломаный» в значении «сломленный», «побитый жизнью», «калека». В старой украинской среде так могли назвать человека с физическим изъяном (хромого, горбатого) или того, кто пережил тяжёлую болезнь. Менее распространённое, но возможное объяснение — прозвище по поведению: «ломаться» в значении «упрямиться», «капризничать», «кривляться». В этом случае Ломаным называли человека с неустойчивым, вздорным характером.

Интересно, что фамилия Ломаненко почти не встречается в Великороссии: там аналогичные прозвища давали суффиксы -ов/-ев (Ломанов). Географически фамилия тяготеет к Полтавщине, Черкасчине и югу Сумщины — регионам старой казацкой колонизации, где модель на -енко была особенно продуктивна. В реестрах Войска Запорожского XVII века встречаются прозвища Ломаный, Ломань, но фамилия Ломаненко, скорее всего, оформилась уже после упразднения полкового устройства, в XVIII–XIX веках, когда казацкие роды получали наследственные фамилии.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: корень «лом-», суффикс прилагательного «-ан-» (ср. рваный, битый) и патронимический суффикс «-енко». Ударение в современном произношении колеблется: Ломанéнко (по общему правилу для фамилий на -енко) и Ломáненко (под влиянием исходного прилагательного). Второй вариант фиксируется в ряде украинских говоров.

Фамилия не элитарная, не дворянская — типичное крестьянско-казацкое именование, которое несло в себе либо внешнюю характеристику предка, либо его житейскую историю. Никаких книжных или церковных корней у неё нет.