Фамилия Лопатышкин — редкий образец русской фамилии, образованной по модели «профессия + уменьшительный суффикс + фамильный суффикс». В основе лежит слово «лопата», но не в прямом значении сельскохозяйственного орудия, а в переносном, прозвищном смысле.

Разберём словообразовательную цепочку. Сначала от «лопаты» образовали прозвище Лопатыш или Лопатышка. Суффикс -ыш-/-ышек в русских прозвищах часто придавал оттенок уменьшительности или ироничной ласки: так могли назвать человека с широкими ступнями, большими ладонями или просто неуклюжего, «лопоухого» (хотя последнее — от другого корня). Затем к основе Лопатыш- добавился притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей сын?» — Лопатышкин. То есть фамилия буквально значит «сын Лопатышки».

Версия о прямой связи с профессией «лопатник» (изготовитель лопат) менее вероятна: для ремесленных фамилий типичны суффиксы -ов/-ев, а не -ин. Однако полностью исключать её нельзя: в северных говорах «лопатышкой» могли называть и того, кто работает лопатой — землекопа или могильщика. Но правдоподобнее всё же прозвищное происхождение, тем более что фамилия встречается в основном в центральных и южных регионах России, где прозвища по внешности были особенно распространены.

Географически Лопатышкины — фамилия не частая, но стабильно фиксируется в документах XIX века по Тульской, Рязанской и Тамбовской губерниям. Встречается и в казачьей среде — на Дону, что указывает на возможное бытование прозвища в среде вольных людей. Интересно, что в переписях XVIII века попадаются однокоренные фамилии: Лопатин, Лопатов, Лопаткин — все от разных форм одного корня. Лопатышкин стоит особняком из-за редкого суффикса -ышк-, который в фамилиях почти не встречается (сравните разве что Малышкин, Голышкин). Эта особенность делает фамилию ценной для ономастов: она сохранила живую народную словообразовательную модель, почти исчезнувшую в XIX веке под напором книжных форм.