Фамилия Лопатский в большинстве случаев — типичная «географическая» фамилия польско-украинского или белорусского происхождения. Суффикс -ский указывает на дворянский или шляхетский корень, либо на происхождение от названия места: Лопата, Лопатино, Лопатка. Носитель такой фамилии, скорее всего, был либо помещиком из имения Лопаты (или похожего), либо выходцем из села с таким названием. В Речи Посполитой фамилии на -ский были особенно распространены среди мелкой шляхты, которая брала фамилию по своему владению.

Но есть и вторая, более прозаичная версия. Фамилия могла возникнуть и в крестьянской среде, но уже не от названия деревни, а от прозвища Лопата. Если человек получил фамилию Лопатский (а не Лопатин или Лопатов), это могло означать, что его предок служил в каком-то военном или ремесленном подразделении, где использовали лопаты — например, был сапёром, землекопом или даже мастером по изготовлению лопат. Суффикс -ский в таком случае появился позже, под влиянием моды на «благородные» фамилии при переписях.

Интересно, что фамилия Лопатский встречается в основном в западных регионах бывшей Российской империи — на Украине, в Беларуси и в Польше. В России она редкая и часто оказывается «переселенческой», принесённой ссыльными или переселенцами. В польском варианте фамилия могла звучать как Łopacki или Łopatski, а в документах XIX века нередко путали Лопатских с Лопацкими — разница в одну букву, но корень мог быть разным: от «лопата» или от «лапа» (звериная лапа).

Если опираться на словарь Б. Унбегауна, то фамилии на -ский с «ремесленной» основой — явление нередкое, но всегда стоит проверять, не первично ли здесь топонимическое значение. Для Лопатского более правдоподобна именно географическая версия: слишком много сёл Лопаты, Лопатино и Лопатка на картах бывшей Речи Посполитой, чтобы игнорировать этот факт.