Фамилия Лубягана — редкая и нестандартная для русского языка. В ней нет привычного суффикса принадлежности (-ов, -ев, -ин), который превращает прозвище в фамилию. Вместо этого мы видим окончание -а, характерное для украинской и белорусской традиции, где фамилии часто застывали в форме именительного падежа. Если бы фамилия была русской по модели, она звучала бы как Лубягин или Лубягов. Таким образом, Лубягана — это, скорее всего, украинская или южнорусская фамилия, причём женская форма (мужская — Лубягана, что нетипично, или исходная мужская — Лубяга). В русской среде фамилии на -ана обычно женские, но здесь основа не меняется, что указывает на её происхождение из регионов, где фамилии склонялись по-другому.

Основа «Лубяг-» восходит к слову «луб» — внутренняя часть коры дерева (липы, вяза), которую использовали для плетения лаптей, коробов, рогож. В диалектах «лубяга» могло означать человека, занятого заготовкой лыка или плетением из него. Это типичное прозвище по ремеслу: предок носителя фамилии был лубяжником — мастером по лубью. Вторая версия, менее вероятная, — от географического названия. В России есть несколько урочищ и речек с корнем «Луб-» (например, река Лубянка), но суффикс -яг- в основе скорее указывает на прозвище, чем на топоним. Суффикс -яг- в русских прозвищах часто придавал экспрессивный оттенок (сравните: «беляга», «синяга»), то есть Лубяга — это не просто «лубяной мастер», а, возможно, человек, которого так прозвали за внешность или манеру поведения.

Фамилия не входит в списки дворянских родов и не встречается в старых боярских книгах. Её носители — выходцы из крестьянской или ремесленной среды, вероятно, из Черниговской, Полтавской или Курской губерний, где было развито плетение из лыка. Написание с двумя «а» на конце (Лубягана) — это либо результат поздней фиксации в паспортных документах, когда женская форма записывалась как мужская, либо указание на то, что исходная фамилия была Лубяган (с ударением на последний слог), что встречается у поляков и белорусов. В любом случае, перед нами фамилия-прозвище, напрямую связанная с народным промыслом, который почти исчез в XX веке.