Фамилия Лупатов — один из тех случаев, когда внешне простая основа скрывает сразу несколько возможных корней, и разобраться в них интереснее, чем кажется. По модели образования это типичная патронимическая (или «прозвищная») фамилия на -ов, то есть отвечает на вопрос «чей?»: сын или потомок человека по имени или прозвищу Лупат.

Самая прямая версия — от прозвища Лупатый. В южнорусских и украинских говорах «лупатый» означало «пучеглазый», «с выпученными или широко раскрытыми глазами». Глагол «лупать» — хлопать глазами, таращиться, а «лупак» или «лупан» — человек с таким взглядом. Прозвище давали либо по заметной внешней черте, либо, в переносном смысле, тому, кто постоянно удивлялся или смотрел во все глаза. Отсюда же фамилии Лупанов, Лупачёв, Лупашов — но Лупатов стоит несколько особняком из-за суффикса -ат-.

Второй, менее очевидный вариант — связь с диалектным словом «лупать» в значении «чистить, сдирать кору, лущить». В некоторых областях так называли человека, занятого обдиркой лыка, коры или шелушением зерна. То есть Лупатов мог быть потомком ремесленника, работавшего с лубом или занимавшегося лущением. Эта версия слабее, потому что фамилии от таких занятий обычно образуются через суффиксы -ник, -арь (Лупальщиков, Лущильников), но полностью исключать её нельзя — прозвища могли давать и по однократному действию.

Есть и третья версия, ономастически спорная: от канонического имени Лупа (производная форма от Лукиан, Лука или Лупа — лат. «волк»). Имя Лупа встречалось в святцах, но было редким, и фамилия Лупатов могла означать «сын Лупы». Однако против этого говорит то, что от имён на -а чаще образуются фамилии на -ин (Лупин), а не на -ов. Поэтому прозвищное происхождение выглядит убедительнее.

Географически фамилия тяготеет к югу России: чаще всего Лупатовых фиксируют в Воронежской, Ростовской, Волгоградской областях, а также на Украине. В дореволюционных переписях встречается и в среде крестьян, и среди мещан — сословной привязки нет.

Если коротко: скорее всего, ваш предок получил прозвище Лупатый за глаза навыкате или за манеру широко открывать их от удивления. Фамилия живая, южнорусская, и в ней нет ни дворянского лоска, ни редкой книжности — зато есть меткая бытовая наблюдательность, из которой и сложились многие русские родовые имена.