Фамилия Лялькина образована от прозвища Лялька. Чаще всего так называли маленьких детей — от распространённого в русских говорах слова «ляля» в значении «дитя», «младенец». Однако у этого прозвища могли быть и другие истоки. Вторая версия связывает его с родом занятий: «ляля» означала также «игрушка, кукла», поэтому Лялькой могли прозвать мастера по изготовлению кукол или торговца ими. Третья, более экзотическая гипотеза, выводит основу из тюркского «лял» — «рубин» или персидского имени Лала («тюльпан»). Эта версия менее вероятна для чисто русской фамилии, но полностью исключать её нельзя: в южнорусских и казачьих областях тюркские заимствования встречались в прозвищах.

Сама фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Ляльк- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Ляльки). Форма Лялькина — женская, но в русской традиции фамилии на -ин склоняются, и в мужском варианте она звучала бы как Лялькин. Такие фамилии чаще всего встречались в северных и центральных губерниях России, где модель на -ин была особенно распространена.

Интересно, что фамилия Лялькина сохранила в основе уменьшительно-ласкательный суффикс -к-, который в прозвищах часто придавал оттенок несерьёзности или нежности. Это отличает её от однокоренных фамилий вроде Лялин, где основа Ляля могла быть и детским словом, и самостоятельным именем. В любом случае, потомок человека по прозвищу Лялька унаследовал фамилию, которая прямо указывает на его предка — ребёнка, игрушечного мастера или, реже, носителя восточного имени.