Фамилия Лыко — редкий случай, когда прозвище перешло в наследственное имя без каких-либо суффиксов, в чистом виде. Это так называемая «неоформленная» фамилия, характерная в основном для украинской, белорусской и южнорусской традиции, где фамилии на -о, -а или просто на согласный встречаются чаще, чем в северной и центральной России. В данном случае основа — нарицательное «лыко» (луб молодой липы или вяза, который мочили, сушили и драли на лапти, корзины, мочала).

Самый прямой и очевидный путь происхождения — от ремесла. Предок мог быть лыкодером или лапотником: человеком, который заготавливал лыко или плёл из него лапти. В крестьянской среде это было распространённое, хотя и низкостатусное занятие. Прозвище Лыко могли дать и по характерной детали внешности или одежды: например, за привычку подпоясываться лыком вместо ремня, за бедность («лыком шит» — поговорка о человеке низкого происхождения) или за что-то, напоминающее лыко по виду — волосы, борода, лохмотья.

В ономастике существует и версия о некалендарном личном имени Лыко. В древнерусской традиции нередко давали «обережные» имена от названий простых, грубых предметов: считалось, что злые духи не позарятся на ребёнка с таким именем. Однако в данном случае прозвищная и профессиональная версия выглядят убедительнее и подтверждаются историческими записями. В словаре древнерусских личных имён С. Б. Веселовского упоминается Лыко, крестьянин, живший в конце XV века в Новгородской земле — регионе, где лапотный промысел был особенно развит.

Географически фамилия Лыко рассредоточена по западу и югу России, Украине и Белоруссии, с заметным скоплением в Смоленской, Брянской и Псковской областях. Там лыкодерство было массовым крестьянским промыслом вплоть до начала XX века. Встречаются и однокоренные фамилии, образованные уже с помощью суффиксов: Лыков, Лыкин, Лычков. Но именно форма Лыко сохраняет прямую связь с исходным прозвищем без добавления «принадлежности» (чей? — Лыков), что делает фамилию более архаичной и прозрачной по смыслу.