Фамилия Лысанов образована по простой и ясной модели: к основе прозвища Лысан добавили типичный русский суффикс принадлежности -ов. Этот суффикс в XV–XVII веках чаще всего означал «сын такого-то» или «из семьи такого-то», поэтому Лысанов — это «сын Лысана». Само прозвище Лысан, скорее всего, указывало на внешнюю примету — отсутствие волос на голове. Лысаном называли лысого человека, и это было настолько броской чертой, что прозвище легко закреплялось.

Но у слова «лысан» было и переносное значение. В некоторых русских говорах так говорили об опытном, бывалом человеке, который «прошел огонь, воду и медные трубы». Тут срабатывала та же логика, что и в устойчивом выражении «старый лысый черт» — лысина ассоциировалась с возрастом и житейской мудростью. Поэтому нельзя с уверенностью сказать, был ли первый Лысан просто плешивым или, наоборот, уважаемым стариком-советчиком.

С точки зрения словообразования фамилия стоит в одном ряду с однокоренными Лысов, Лысаков, Лысых, Лысенко. Но в отличие от них, модель на -анов встречается реже и часто указывает на более архаичную или диалектную основу. В документах фамилия встречается преимущественно в центральных и северных губерниях России — в Вятской, Костромской, Архангельской. Это косвенно подтверждает, что прозвище бытовало именно в северных говорах, где слово «лысан» фиксируется в значении «лысый человек» и «пройдоха».

Итог простой: предок современных Лысановых получил прозвище за лысину или за житейский опыт, а его дети и внуки закрепили это прозвище в фамилии. Других версий, достойных серьёзного рассмотрения, нет — попытки связать фамилию с тюркским корнем или с растением «лысан» (несуществующим) не выдерживают критики и остаются на уровне любительской этимологии.