Фамилия Любишкин образована от мирского имени или прозвища Любишка. Это краткая форма, которая могла относиться как к мужчине, так и к женщине. В основе лежит общеславянский корень «люб-» со значением «любить, миловать». Чаще всего Любишкой в быту называли человека с женским именем Любава (то есть «любящая, любимая») или мужским Любомир («любящий мир»). Однако прозвище могло закрепиться и за тем, кого просто ласково называли в семье или общине — в старой Руси такие внутрисемейные имена были обычным делом.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Любишкин буквально означает «сын Любишки» или «из рода Любишки». Это типичная патронимическая модель для центральных и северных русских земель, где фамилии на -ин столь же распространены, как на -ов.

Важно, что фамилия Любишкин не связана с глаголом «любить» в прямом значении «влюблённый» или «любовник». В ономастике это имя относят к группе «охранительных» или пожелательных имён: давая ребёнку имя Любишка, родители желали ему счастливой и любимой жизни. В словаре Б. Унбегауна подобные фамилии разбираются как производные от неканонических личных имён, популярных в дохристианской и раннехристианской Руси.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и центральным областям России. В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются упоминания крестьян и посадских людей с именем Любишка, но документальных записей о конкретных носителях фамилии Любишкин того времени сохранилось немного. Это говорит о том, что фамилия оставалась преимущественно сельской, не попав в ранние дворянские родословные.

Редкий суффикс -шкин (а не -ушкин или -ечкин) делает фамилию узнаваемой и отличает её от однокоренных Любимов, Любавцев или Любомиров. Если ваши предки носили фамилию Любишкин, скорее всего, они происходили из крестьянской или мещанской среды, где мирские имена держались дольше, чем в высших сословиях.