Фамилия Любишина — женская форма от Любишин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей сын?» — «Любишин», то есть сын Любиши. А вот Любиша — это не имя в современном понимании, а уменьшительно-ласкательная форма от одного из нецерковных имён или прозвищ на «Люб-». Основа здесь — «люб», от глагола «любить» или прилагательного «любый» (милый, дорогой). В древнерусской антропонимии были популярны имена-обереги: Любим, Любава, Любиша. Любиша — это «маленький любимый», «любимчик». Такое имя могли дать ребёнку, чтобы задобрить судьбу или подчеркнуть его желанность в семье.

Суффикс -ша для мужских имён — редкая, но не уникальная черта. Он встречается в именах-полуформах: Гриша, Миша, но там основа усечена (Григорий → Гриша). В случае Любиша основа полная, а -ша выступает как ласкательный или уменьшительный формант, аналогично именам Тиша (от Тихий) или Малюта. То есть Любиша — не сокращение от длинного имени, а самостоятельное прозвище или некалендарное имя, которое напрямую образовано от «любить».

Географически фамилия Любишин (и Любишина) тяготеет к северо-западу России. По данным ономастов, такие фамилии с корнем «люб-» и уменьшительным суффиксом чаще встречаются в бывших новгородских и псковских землях. Там была распространена традиция давать детям «домашние» имена, которые позже становились фамилиями. В переписных книгах XVI–XVII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с именем Любиша, хотя в открытых источниках эти записи единичны.

Важно не путать Любишина с фамилиями на -ов/-ев от того же корня (Любимов, Любавцев). Модель на -ин указывает на более архаичный, патронимический способ образования: фамилия закрепилась от прямого прозвища отца, а не от канонического имени. Социально носители фамилии Любишин в основной массе относились к крестьянскому или посадскому сословию — дворянские роды с таким окончанием и корнем практически не фиксируются. Это фамилия «низовая», народная, без претензии на боярскую родословную.

В редких случаях нельзя исключать и вариант, что Любиша — это не прозвище, а искажённое крестильное имя. Например, от Любомир (южнославянское влияние) или от Людовик (через польское посредничество), но для центральной России эти версии маловероятны: слишком сложный путь заимствования, когда на месте уже было своё, прозрачное по смыслу слово. Так что самая надёжная версия — прозвище-оберег с корнем «люб».