Фамилия Любишева происходит от мужского имени или прозвища Любиш. В основе лежит прилагательное «любимый» — так могли назвать долгожданного ребёнка, особенно если он был первенцем или появился после нескольких неудачных беременностей. В русской традиции дохристианские имена вроде Любим, Любимко, Любиш были распространены повсеместно: они несли пожелание счастливой судьбы и родительской привязанности.

Есть и вторая версия: прозвище Любиш давали не ребёнку, а взрослому мужчине. Так могли называть человека, с которым приятно иметь дело — радушного хозяина, интересного собеседника, того, кого уважали и ждали в гости. Реже прозвище закреплялось за влюбчивым человеком, не пропускавшим ни одной юбки.

Маловероятно, что фамилия связана с женским именем Любовь в народной форме Любиш. Для фамилий на -ов/-ев, как правило, основой служит мужское имя, а не женское — иначе форма была бы Любишин или Любишев с другим суффиксом.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Любишев — это «сын Любиша». Такая модель образования типична для центральных и северных регионов России, где фамилии на -ов/-ев составляют большинство. Встретить Любишевых можно в Рязанской, Тамбовской, Нижегородской областях — именно там фиксируется наибольшая плотность носителей.

Родственные фамилии — Любимов, Любавин, Любушкин — образованы от того же корня, но с разными суффиксами. Любишева стоит в этом ряду особняком: форма на -иш встречается реже, чем на -им или -ав, и указывает на более архаичную, возможно, прозвищную основу.