Фамилия Любишин образована по одной из самых древних и распространённых на Руси моделей: от личного имени или прозвища с помощью суффикса принадлежности -ин. Этот суффикс указывает на то, что родоначальник носителей фамилии — человек по имени или прозвищу Любиша.

В основе имени Любиша лежит прилагательное «любимый». В дохристианской Руси такие имена-обереги давали ребёнку, чтобы он рос в любви и согласии, или же как пожелание доброй судьбы. Славянское имя Любиша зафиксировано в средневековых источниках, и оно не имело прямого отношения к церковным святцам — это было чисто мирское, бытовое имя.

Есть и другая, не менее правдоподобная версия: Любишей могли прозвать взрослого человека. В этом случае прозвище отражало его характер или манеру общения. Так могли назвать всеми уважаемого, душевного мужчину, приятного собеседника или желанного гостя. Впрочем, в народе прозвище Любиша могло пристать и к человеку влюбчивому, неравнодушному к женскому полу — такое значение тоже встречается в говорах.

Гораздо менее вероятно, что фамилия восходит к женскому имени Любовь. Хотя Любиша и звучит как уменьшительная форма от Любови, в ономастике принято считать, что фамилии на -ин от женских имён образуются крайне редко и обычно в тех случаях, когда женщина была главой семьи (например, у вдов). Для фамилии Любишин такое объяснение — исключение, а не правило.

Фамилия Любишин — довольно редкая. Она встречается в центральных областях России, а также в среде потомков переселенцев на Урале и в Сибири. Носители этой фамилии могут проследить свои корни до человека, которого в его окружении называли Любиша — по имени, данному при рождении, или по прозвищу, полученному за добрый нрав.