Фамилия Магдесян образована от армянского мужского имени Магдес. В его основе лежит мусульманское имя Магди, которое восходит, в свою очередь, к арабскому слову «хаден» - «вести за собой, направлять на путь истины, руководить». Таким образом, имя Магдес можно перевести как «следующий по пути, предначертанному Аллахом», «посланный Аллахом, преподнесенный в дар».