Фамилия Магдилов звучит редко и сразу обращает на себя внимание восточным корнем. Её основа — личное имя Магди, которое в разных тюркских и кавказских языках может означать «желанный» или «долгожданный» (от арабского «магди» — ведомый правильным путём, близкое к имени Махди). В некоторых диалектах имя Магди давали ребёнку, которого ждали долго, или в знак религиозного почитания.

Модель образования здесь нестандартная. Если бы фамилия возникла по типичной русской схеме, мы бы увидели Магдиев или Магдин. Суффикс -ов в сочетании с основой на -ил встречается реже и указывает на то, что имя Магди могло бытовать в форме Магдил — либо как вариант произношения, либо как уменьшительно-ласкательная форма. В таком случае фамилия буквально значит «сын Магдила». Это характерно для регионов, где русская фамильная модель накладывалась на местные имена с необычным для славянского уха окончанием.

Географически фамилия Магдилов тяготеет к Северному Кавказу и Закавказью — в первую очередь к Дагестану, Чечне и Азербайджану. В этих местах имя Магди (или Махди) распространено у народов, исповедующих ислам, а фамилии на -ов там стали массово оформляться в XIX — начале XX века при документации населения. Носители фамилии могли принадлежать к разным сословиям: от крестьян и ремесленников до сельских мулл, но конкретных данных о социальном статусе предков по одной фамилии нет.

В русском языке фамилия склоняется как обычное мужское существительное второго склонения: Магдилова, Магдилову, Магдиловым. Ударение, скорее всего, падает на второй слог — МагдИлов, хотя в семейной традиции может звучать иначе. Сравнение с однокоренными фамилиями — Магдиев, Махдиев, Магомедов — показывает, что Магдилов стоит особняком: её редкий суффиксальный облик говорит о том, что имя-основа успело обрасти местной огласовкой до того, как попало в официальные документы.