Фамилия Магильницкий — редкий пример, когда географическая основа фамилии ведет не к русскому, а к польскому топониму. В основе лежит название города Магильница, который находился в Варшавской губернии. Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, был выходцем оттуда — либо родился в Магильнице, либо владел там землей. Такая модель образования фамилий (по названию места жительства с суффиксом -цк-) типична для польской шляхты и западнорусских земель, где оседлость часто обозначали именно через «-ский»/«-цкий».

Сам топоним Магильница, по наиболее убедительной версии, связан с растением «магильница», которое в изобилии росло в той местности. Что это за растение — спорный вопрос: в польских говорах так могли называть один из видов полыни или мятлика. Название закрепилось за поселением, а затем перешло в фамилию.

Вторая версия, менее правдоподобная, отсылает к польскому слову magiel — «каток» или «помещение, где катают белье» (ручная гладильная машина). По этой логике, Магильницкий мог быть потомком того, кто работал с таким катком, то есть гладильщика. Но здесь слабое место — словообразование: от magiel естественнее ожидать фамилии Магельский или Магельницкий, без «и» в корне. Поэтому версия с растением выглядит надежнее.

Среди носителей фамилии, зафиксированных в Книге памяти Республики Польша, — Магильницкий Феликс Иосифович, 1924 года рождения, уроженец деревни Разбовичи Ивьевского района (ныне Гродненская область Беларуси). Это подтверждает, что фамилия бытовала на западе современной Беларуси, в зоне исторического польского влияния, где топонимические фамилии на «-ский» были нормой для местной мелкой шляхты и зажиточных крестьян.

Сравните с однокоренными фамилиями: Магильницкий — единственная форма с таким корнем в восточнославянском ономастиконе. Нет массовых вариантов вроде Магильцев или Магильников, что говорит о локальном, «штучном» происхождении — фамилия привязана к одному конкретному топониму, а не к нарицательному слову.