Фамилия Магоьедов — одна из тех, где редкость написания сразу бросается в глаза. Мягкий знак в середине, перед буквой «е», выглядит необычно для русской фамилии. Скорее всего, перед нами результат искажения при записи или особенность местного произношения. Исходная, более распространённая форма — Магомедов, одна из самых частых фамилий на Северном Кавказе и в Закавказье.

Основа фамилии — арабское имя Магомед (вариант имени Мухаммад, «восхваляемый», «прославляемый»). В русской традиции имя Магомед закрепилось как одна из форм имени пророка, особенно у народов, исповедующих ислам. Фамилия образована по стандартной русской патронимической модели: к имени отца (Магомед) добавили суффикс -ов, что буквально означает «сын Магомеда» или «принадлежащий к роду Магомеда». Это типичный случай, когда тюркское или кавказское имя «обрусело» через присоединение русского фамильного суффикса.

Написание «Магоьедов» (с мягким знаком) — вероятная ошибка переписчика или паспортиста, который на слух передал мягкое произношение согласного перед «е». В советское время при выдаче паспортов и записи в метрических книгах такие «слуховые» варианты были не редкостью, особенно в отдалённых районах или при работе с нерусскими фамилиями. Таким образом, носитель фамилии Магоьедов почти наверняка происходит из семьи, где предка звали Магомед, а сама фамилия — местный, возможно, дагестанский или чеченский вариант общекавказской фамилии Магомедов.

Встречается эта форма в единичных записях, в основном в южных регионах России. Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, принадлежат к одному роду, и искажение закрепилось именно в их ветви.