Фамилия Магукян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -ян (вариант -янц, -енц). Этот суффикс указывает на принадлежность: «из рода», «потомок». В русской передаче фамилия закрепилась в форме Магукян, хотя в самой Армении может произноситься как Магукян или Магукянц, в зависимости от диалекта.

Основа фамилии — личное имя или прозвище Магук. Это уменьшительно-ласкательная форма от имени Магнак (Магнака) или, что вероятнее, от имени Магак. В армянском языке имя Магак может означать «маленький» или быть вариантом имени, связанного с корнем «маг» — «волшебник», «жрец» (от древнеперсидского maguš). Однако в бытовой среде Магук чаще всего выступало как прозвище, данное человеку невысокого роста или младшему в семье. Таким образом, Магукян — это «потомок Магука», то есть человека, которого в окружении называли ласково-уменьшительно.

Географически фамилия Магукян встречается преимущественно в западных и центральных областях исторической Армении, а также среди потомков армян, переселившихся в XIX веке на Кубань и в Ростовскую область. В современной России носители фамилии живут в Краснодарском крае, Ставрополье и Москве. В диаспоре фамилия распространена в Ливане и Сирии, куда армяне бежали после геноцида 1915 года.

Интересная деталь: в отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые указывают на отца (Петров — сын Петра), армянская модель с -ян фиксирует родовую принадлежность. Поэтому Магукян — это не «сын Магука», а скорее «из рода Магуковых». В документах Российской империи фамилию могли записывать как Магуков или Магукьянц, но в советское время закрепился именно вариант с -ян. Фамилия не имеет отношения к тюркским корням, хотя созвучна некоторым северокавказским фамилиям — это чисто армянское образование.