Фамилия Макалькова — из числа тех, что хранят в себе сразу несколько возможных историй, и разобраться в них помогает география и словообразование. В основе, скорее всего, лежит нецерковное имя или прозвище Макаль, а оно, в свою очередь, восходит к глаголу «макать». Прозвище могли дать человеку, который что-то макал — хлеб в соль, перо в чернила, лучину в сало, или же тому, кто занимался маканием свечей в старых кустарных производствах. Есть и другая, менее бытовая версия: в некоторых южнорусских и украинских говорах «макаль» — это название певчей птицы, малиновки или зарянки, так что прозвище могло быть и «птичьим», по повадкам или голосу.

Суффикс -к- в основе Макальков указывает на то, что фамилия образована от производной формы имени или прозвища. Сначала появилось прозвище Макаль, затем от него — патроним Макалько (сын Макаля), а уже от него, с помощью стандартного русского суффикса принадлежности -ов, возникла фамилия Макальков. Форма Макалькова — женский вариант, но по происхождению она принадлежит к тому же гнезду. Интересно, что фамилия эта встречается в основном в центральных областях России и в Поволжье, что косвенно подтверждает её связь с ремесленным или бытовым прозвищем, а не с редким церковным именем.

С точки зрения ономастики, фамилия Макалькова стоит в одном ряду с Макаровым, Макарьевым и Макашиным, но отличается от них суффиксальной цепочкой. Если Макаров прямо указывает на имя Макар (от греческого «макариос» — блаженный), то Макальков уводит нас в сторону народной, «уличной» ономастики, где прозвища часто были ярче и конкретнее канонических имён. Спорной можно считать версию о происхождении от литовского или польского корня (ср. польское «makać» — макать), но для русской фамилии она избыточна: все нужные значения даёт родной язык.

Таким образом, предки носителей фамилии Макалькова — это, вероятно, люди, получившие прозвище по действию или ремеслу: свечник, переписчик книг или просто человек с привычкой макать хлеб в подливу. Сословная принадлежность могла быть разной — от крестьян до посадских, но фамилия не несёт в себе аристократического оттенка, что типично для прозвищных фамилий, сложившихся в XV–XVII веках в среде служилых и тяглых людей.