Фамилия Макалус — редкий случай в русском ономастиконе. Её происхождение почти наверняка не славянское, а западно- или южноевропейское, и уходит корнями в средневековую латынь. В основе лежит латинское слово macula — «пятно», «пометка», «след». В эпоху Возрождения в католических школах и университетах из этого корня образовали прозвища для людей с заметной внешностью (родимое пятно, веснушки) или для тех, кто занимался учётом, переписыванием — то есть «ставил пометки».

Сама фамилия Макалус — это латинизированная форма на -us, характерная для польской или литовской шляхты, а также для учёных кругов Речи Посполитой. В польском языке фамилия могла звучать как Makalus, а в белорусском или украинском — как Макалюс. В Россию она попала, скорее всего, с переселенцами из западных губерний после разделов Польши или с выходцами из духовного сословия, где латинские формы фамилий были в ходу у семинаристов.

Словообразовательно фамилия стоит особняком: в русской традиции нет суффикса -ус, образующего фамилии. Это маркер искусственного, книжного происхождения. Если бы фамилия была народной, она звучала бы как Макалов, Макалин или Макальский. Поэтому носитель фамилии Макалус — потомок человека, чьё прозвище записали по латинской моде, возможно, в метрических книгах католического прихода или в документах Виленской или Гродненской губернии.

Встречается фамилия в основном в Беларуси, на западе Украины и в Польше. В России она крайне редка, и её носители — скорее всего, потомки ссыльных или переселенцев конца XIX — начала XX века. Разобрать фамилию по русским суффиксам (как Макал + ус) бессмысленно: это не членение на корень и окончание, а цельная заимствованная модель.