Фамилия Маклагина — женская форма от Маклагин, а та, в свою очередь, образована от прозвища Маклага. Это прозвище — довольно редкое, но многозначное. В его основе лежит слово «маклак», у которого в русских говорах было как минимум три разных значения.

Первое значение — «мосол», то есть большая кость. Такое прозвище могли дать человеку либо за крупное телосложение, либо, наоборот, за худобу, когда кости заметно выступали. Второе значение связано с торговлей: маклаком (или маклагой) называли перекупщика, посредника на торгах, а также торговца подержанными вещами. В этом случае прозвище относилось к «профессиональным» именованиям и прямо указывало на род занятий предка. Третье, более редкое значение — скупец. В некоторых говорах так называли прижимистого человека.

Фамилия построена по типичной модели: к основе Маклаг- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Маклаги). Такая модель была особенно распространена в северных и центральных областях России. В итоге потомок человека с прозвищем Маклага получал фамилию Маклагин, а его жена или дочь — Маклагина.

Стоит отметить, что ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Макла́гина. Это соответствует произношению исходного слова «макла́к». Встречается также вариант с ударением на первый слог, но он менее характерен для этой словообразовательной модели.