Фамилия Макунас — случай, когда географический ключ важнее морфологического. В русском языке она звучит как фамилия, но её основа не славянская, а литовская. Макунас — это русифицированная форма литовской фамилии Makūnas. Корень «mak-» в литовском языке связан с глаголом mokėti (уметь, мочь) или с maikas (мешок, кошель). Однако самая вероятная версия — от личного имени или прозвища Makas, которое могло означать «маленький», «коротышка» (ср. лит. makas — «короткий»). Суффикс «-ūnas» (в русской передаче «-ун») — типичный литовский патронимический суффикс, указывающий на происхождение: «сын Макаса» или «потомок Мака».

География фамилии привязана к историческим территориям Великого княжества Литовского. Носители Макунас — это потомки литовцев, которые жили на землях современной Литвы, а также в приграничных районах Беларуси и Польши. В XIX веке, после разделов Речи Посполитой, многие литовские фамилии попали в российские метрические книги в русифицированном виде. Так Makūnas превратился в Макунас, а иногда и в Макунов — под влиянием русских фамилий на «-ов». Встречается и вариант Макунайтис, где суффикс «-aitis» указывает на сына, но в русской записи он сократился.

Спорных версий немного. Иногда фамилию пытаются связать с финно-угорскими корнями (makka — «ягода»), но для Литвы это маловероятно. Другая гипотеза — от литовского makuoti (бить, колотить), но прозвище «Боец» не закрепилось в фамилиях так массово. Надёжнее придерживаться патронимической модели: основой стало личное имя или прозвище, а суффикс указал на родство.

Социальный контекст типичен для литовских крестьянских фамилий. Макунас — не шляхетская, а простонародная фамилия, распространённая среди земледельцев и ремесленников. В дворянских гербовниках она не числится. После присоединения Литвы к Российской империи фамилию фиксировали при переписях, и написание закрепилось в документах. Сегодня Макунас встречается в Литве, а среди русскоязычных — у потомков литовцев, переехавших в Россию в советское время. Фамилия редкая, но узнаваемая благодаря характерному литовскому суффиксу, который сразу отличает её от славянских аналогов.