Фамилия Малакеев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Малакеев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Малакеев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Малакеев образована от имени Малакей. По одной из версий, оно восходит к турецкому слову malak – «буйволенок». Имена, в основе которых лежит название детеныша какого-либо животного, довольно популярны на Востоке. Согласно другой гипотезе, Малакей — вариант имени Малахий, которое в переводе с древнееврейского означает «посланник Божий». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Малакеев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Малакеев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.