Фамилия Малегина — женская форма фамилии Малегин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или нецерковным именем, которое носил предок по мужской линии. Основа фамилии — «Малега», слово, которое в русских говорах имело несколько значений, но все они указывают на конкретную характеристику человека.

Самая вероятная версия отсылает к диалектному слову «малый» в уменьшительной форме. «Малега» — это тот же «малец», «малыш», «маленький». Так могли прозвать невысокого ростом человека или младшего в семье, младшего сына. В старину прозвища по росту и возрасту были очень распространены: Большак, Меньшой, Малюта. Малега стоит в том же ряду.

Менее распространённая, но возможная трактовка связывает фамилию с глаголом «малевать» — красить, рисовать. В этом случае Малегой могли прозвать маляра, иконописца или просто человека, который любил разрисовывать, «малевать» что-то. Однако эта версия слабее: суффикс «-ега» в прозвищах от глаголов встречается реже, чем в именах, образованных от прилагательных.

Фамилия Малегин — типичная модель на «-ин», указывающая на принадлежность: «чей?» — Малегин, то есть сын Малеги. Такие фамилии чаще всего возникали в северных и центральных областях России, где был распространён именно этот суффикс. В южных регионах предпочтение отдавали суффиксу «-ов».

Интересно, что фамилия Малегин не слишком частотна, но имеет однокоренные варианты: Малеев, Маленков, Малёшин. Все они образованы от разных форм одного корня, но Малегин — одна из самых архаичных по звучанию, сохранившая редкую уменьшительную форму.