Фамилия Малекян — яркий пример армянской модели фамилии, которая строится на основе личного имени или прозвища и суффикса -ян. В русской традиции такие фамилии часто записывали с окончанием -ов или без изменений, но Малекян сохранила исходную армянскую огласовку.

В основе лежит имя Малек или Малеки. Это восточное имя, восходящее к арабскому «малик» — «царь, владыка». В армянском языке оно могло закрепиться как прозвище человека властного, уважаемого или же происходить от уменьшительной формы имени. Примечательно, что в некоторых тюркских языках слово «малек» имело значение «ангел», что добавляет вторую версию: фамилия могла указывать на кроткий нрав или даже на религиозное прозвище.

Суффикс -ян (в старой орфографии — -янц) указывает на принадлежность к роду: «из рода Малека». Это аналог русских фамилий на -ов/-ев. В армянской диаспоре фамилия Малекян встречается в Иране, Ливане и Сирии, где потомки носителей сохранили исходное произношение без русификации.

Редкость фамилии в том, что она не перешла в массовый слой армянских фамилий на -ов (типа Малеков), а осталась в форме, близкой к оригиналу. Это говорит о том, что предки носителей, вероятно, жили в регионах с сильным влиянием арабского или персидского языков, где имя Малек было распространено. Никаких документальных свидетельств о дворянстве или известных деятелях с этой фамилией нет — она типична для ремесленников, торговцев или крестьян, получивших фамилию по отцу.