Фамилия Малунова происходит от мирского имени или прозвища Малун. В основе фамилии лежит корень «мал-», который в древнерусских семьях часто использовался для ласкового обращения к ребенку. Родители могли назвать долгожданного или младшего сына Малуном, Малеем или просто Малым, вкладывая в это имя не столько указание на рост, сколько нежность и заботу.

По словообразовательной модели фамилия Малунова относится к самому распространённому типу русских фамилий — притяжательным на -ов/-ев. Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: «чей?» — Малунов, то есть сын или потомок Малуна. Со временем форма закрепилась в женском роде — Малунова, хотя исторически так называли жену или дочь Малуна.

Интересно, что в русской ономастике прозвища с корнем «мал-» не всегда были уменьшительными. В некоторых диалектах «малун» могло означать человека невысокого роста или младшего в роду. Однако в случае с этой фамилией правдоподобнее выглядит версия ласкательного имени: в крестьянской среде ребёнка часто называли просто Малой или Малун, и это имя закреплялось за ним на всю жизнь, переходя в фамилию следующему поколению.

Географически фамилия Малунова встречается в центральных и северных регионах России, где были распространены подобные «домашние» прозвища. В отличие от фамилий, образованных от полных церковных имён (например, Иванов или Петров), Малунова несёт в себе отпечаток бытовой, неформальной традиции именования, что делает её ценной для изучения народной культуры.