Основой фамилии Малунова послужило мирское имя Малун. Фамилия Малунова, скорее всего, была образована от ласкательного имени Малун, которое родители дали долгожданному, любимому ребенку. В семьях ребенка часто называли просто Малой, Малец или Малун. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Малун, со временем получил фамилию Малунова.