Фамилия Малуна — одна из тех, чья форма сразу привлекает внимание. В русской фамильной системе окончание -а чаще указывает на женскую фамилию (типа Кузнецова, Соколова), но здесь мы видим редкую модель: Малун + а. Скорее всего, перед нами не женский вариант, а фамилия, застывшая в форме прозвища или имени, которое в документах записали как «Малуна». Мужчины с такой фамилией — не исключение, а норма.

Основа — Малун — восходит к имени Малуша или Мала. В древнерусском языке «малый» означало не только размер, но и младшего в семье, младшего сына. От этого корня образовалось множество имён: Малей, Малуха, Малуша, Малун. Имя Малун могло быть уменьшительно-ласкательным от имени Малафей или Малахия, но проще и правдоподобнее видеть в нём прямое прозвище «маленький». В говорах существовало слово «малун» — так в некоторых регионах называли невысокого человека или ребёнка.

Есть и другая, более редкая версия: фамилия может быть связана с диалектным «малун» — так в псковских и тверских говорах называли вид гриба (груздь или волнушку). В этом случае прозвище дали бы грибнику или человеку, похожему на гриб по какой-то примете. Но версия с именем-прозвищем надёжнее: она объясняет и суффикс -ун, характерный для русских прозвищ (крикун, молчун, бегун), и то, что фамилия встречается в основном в центральных и северных областях России.

Фамилия редкая. В дореволюционных списках она почти не попадается, что говорит о её позднем закреплении или о том, что носители были из крестьян, не оставивших письменных следов. В современной России Малуна встречается единично, чаще всего в Тверской и Новгородской областях. Написание с ударением на последний слог — Малуна́ — тоже указывает на северное или северо-западное происхождение, где такие формы не редкость.

По сути, фамилия Малуна — это прямое указание на предка: скорее всего, он был младшим в семье или просто невысоким человеком. Никакой тайны, только живое слово, которое когда-то было повседневным прозвищем.