Фамилия Малышкевич — яркий пример того, как личное или семейное прозвище, данное по росту или возрасту, закрепилось в официальном родовом имени. В её основе лежит имя или прозвище Малышка. В старые времена маленького ребёнка в семье часто называли не строгим крестильным именем, а домашним — Мальцом, Малюто́й, Малышом или Малышкой. Это ласкательное прозвище могло остаться за человеком на всю жизнь, даже когда он вырастал, и со временем передалось его детям.

Впрочем, есть и другая версия происхождения: прозвище Малышка могли дать не ребёнку, а взрослому человеку невысокого роста. Прозвища, указывающие на внешние признаки, были очень распространены на Руси, и маленький рост — одна из самых частых причин для такого именования.

Сама фамилия Малышкевич образована по типичной для западных регионов модели: к основе «Малышк-» добавили суффикс «-евич». Этот патронимический суффикс (означающий «сын такого-то») характерен для украинских, белорусских и польских фамилий. В отличие от великорусских фамилий на «-ов» и «-ин», которые чаще встречаются к северу и востоку, фамилии на «-евич» и «-ич» массово бытовали на землях, входивших в состав Речи Посполитой. Таким образом, носители фамилии Малышкевич, скорее всего, происходят из западнорусских земель — современной Беларуси, Украины или восточных районов Польши.

Интересно, что фамилия Малышкевич — редкая по сравнению с однокоренными Малышев или Мальцев. Это объясняется именно её суффиксом: фамилии на «-евич» в целом менее распространены в современной России, чем фамилии на «-ов». Тем не менее, она сохраняет прямую и прозрачную связь с исходным значением — «потомок Малышки».