Фамилия Малюгин образована от личного имени или прозвища Малюга. В основе лежит украинское слово «малюк» — «маленький ребенок». Чаще всего такое имя давали младшему сыну в семье, и это объяснение выглядит наиболее естественным: имя закрепляло порядок рождения, а не внешность. Менее правдоподобная версия связывает Малюгу с прозвищем для невысокого, миниатюрного человека. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Малюгин — «сын Малюги». Словообразовательная модель простая и типичная для русских фамилий, образованных от основ на -а. Сравните с фамилиями Малыхин, Малюков, Малеев — все они восходят к тому же корню «мал», но с разными суффиксами. В ономастических справочниках фамилия Малюгин обычно связывается с мирским именем, а не с прозвищем, что подтверждает первая версия. Из носителей фамилии наиболее известен Леонид Антонович Малюгин (1909–1968) — драматург, литературный критик и публицист, лауреат Сталинской премии.