Фамилия Малюго ставит перед исследователем вопрос в первую очередь о происхождении суффикса. В русской ономастике фамилии на -го (Малюго, Долго, Живаго) — редкая и архаичная группа. Чаще всего это застывшая форма родительного падежа прилагательного, характерная для юго-западных земель (территории современной Украины, Беларуси) или для старых московских фамилий, восходящих к прозвищам XVI–XVII веков. В случае с Малюго основа очевидна: корень «мал-» (маленький, младший, незначительный).

Самый прямой путь — видеть в основе прозвище Малюга, то есть «малыш», «коротышка» или «младший в семье». В древнерусском языке слово «малюга» употреблялось именно в таком значении — как ласковое или насмешливое именование невысокого человека или младшего сына. Суффикс -юг- в этом слове имеет уменьшительно-уничижительный оттенок, как в словах «ворюга», «зверюга», но без резко отрицательной окраски, скорее с оттенком фамильярности. Таким образом, фамилия Малюго могла возникнуть как дворовое прозвище, которое затем закрепилось за потомками: «Малюгин сын» со временем превратилось в «Малюго».

Есть и другая версия, менее вероятная, но любопытная. В некоторых говорах «малюга» — это название мелкой рыбы (например, малька или снетка). В этом случае прозвище мог получить рыбак или человек, промышлявший ловлей мелкой рыбы. Однако эта версия не имеет широкого распространения в ономастических словарях и уступает «ростовой» гипотезе.

Регионально фамилия Малюго тяготеет к южным областям России и востоку Украины. Встречается она нечасто, что подтверждает её архаичный характер: такие фамилии редко переживали массовую унификацию в XIX веке, когда многие «неудобные» окончания заменяли на стандартные -ов/-ев. В словарях фамилия не фиксируется как дворянская или старобоярская — скорее всего, она возникла в крестьянской или казачьей среде, где прозвища передавались напрямую, без книжного оформления.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Малюгин, Малюков, Малеев) показывает, что Малюго — самая редкая форма. Если Малюгин — это типичная «сыновья» фамилия (чей сын? — Малюгин), то Малюго — это прямое прозвище, которое не стали переделывать. Именно эта черта делает фамилию ценной для историка: она сохранила живой язык допетровской эпохи, когда человека могли назвать не по отцу, а по его собственному признаку, и это имя оставалось с семьей на века.