Фамилия Мамутины — один из тех случаев, когда за одним написанием может скрываться два совершенно разных корня, и без исторического контекста легко ошибиться. Разбираться с её происхождением стоит не с готового ответа, а с двух версий, которые спорят друг с другом.

Первая и самая прямая версия отталкивается от прозвища Мамута. В. Даль в своём словаре связывает слово «мамут» с мамонтом — ископаемым животным, которое в народном сознании ассоциировалось с чем-то огромным и мощным. Прозвище Мамута могли дать крупному, рослому, физически крепкому человеку. Такая модель образования фамилий — от прозвища по внешнему признаку — очень распространена в русской среде. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Мамутин», то есть сын или потомок Мамуты.

Вторая версия выводит фамилию из тюркского имени Мамут. Это диалектный, упрощённый вариант имени Мухаммет (от арабского «восхваляемый, прославляемый»). В среде татар, башкир и других тюркских народов имя Мамут было широко распространено, и при переходе в русскую среду оно легко обрастало русским суффиксом -ин, превращаясь в фамилию. Эта гипотеза правдоподобна там, где фамилия Мамутин встречается в Поволжье или на Урале — регионах давнего русско-тюркского соседства.

Какая версия вернее для конкретного рода Мамутиных — сказать без генеалогического исследования невозможно. Фамилия могла возникнуть и в крестьянской среде центральной России, и в среде крещёных татар. Сам суффикс -ин (а не -ов) чаще встречается в северных и центральных областях России, но это не строгое правило. Единственное, что можно сказать уверенно: фамилия не является поздней искусственной или семинарской — она явно бытовая, образовалась в народе, а не в канцелярии.