Фамилия Мамуто — редкий случай, когда ударение, скорее всего, падает на последний слог: Мамуто́. Это сразу выдаёт её нерусское происхождение. В русском языке фамилии с окончанием на -о обычно имеют украинские или белорусские корни (как Коваленко, Тимошенко), но Мамуто — не совсем типичный пример. Скорее всего, перед нами русифицированная форма греческой или молдавской фамилии.

Вероятнее всего, основа фамилии — греческое имя Мамут или Мамутос, которое является народной формой имени Мамант (от греческого Mamas — «сосущий грудь», то есть младенец). В православных святцах известен мученик Мамант, и в южнорусских и причерноморских областях это имя было распространено среди греков и потомков греческих переселенцев. Когда носитель такого имени оказывался в русскоязычной среде, фамилию записывали по-простому: отсекали греческое окончание -ос и оставляли основу Мамут + русское окончание -о (по аналогии с украинскими фамилиями). Так появилось Мамуто.

Есть и вторая, менее вероятная версия — тюркская. Слово «мамут» в тюркских языках означает «мамонт» (ископаемое животное) или, в переносном смысле, «огромный, неуклюжий человек». В этом случае фамилия могла быть прозвищем великана или силача. Но против этой версии говорит то, что у тюркских фамилий редко встречается окончание -о, обычно они оформляются суффиксами -ов/-ев или -оглы.

Географически фамилия Мамуто встречается в основном на юге России, в Краснодарском крае и Ростовской области, а также в Молдове и на Украине. Это подтверждает связь с греческими или молдавскими общинами Причерноморья. Сословной принадлежности у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и мещане — греческие колонисты в XIX веке были разного достатка.