Фамилия Мананова — женская форма, а её мужской вариант Мананов. В основе фамилии лежит не церковное, а народное, обиходное имя. Скорее всего, это производная форма от крестильного имени Мануил, которое в переводе с древнееврейского означает «с нами Бог». В русской бытовой традиции полное церковное имя часто сокращали, и Мануил превращался в Манана (или Мана). Такая модель словообразования характерна для простонародной среды: от усечённой основы с помощью суффикса -ов образовывали фамилию, буквально означавшую «сын Манана».

Есть и вторая версия: имя Манан могли давать как уменьшительную форму от имени Мамант (греч. «сосущий грудь», «материнский»). Оба варианта — Мануил и Мамант — в народе звучали похоже, поэтому разобрать, от какого именно имени пошла фамилия, сегодня почти невозможно. Но в любом случае основатель рода был человеком из простого сословия — крестьянином или ремесленником, которого в быту звали не полным церковным именем, а домашним, сокращённым.

Фамилия Мананова встречается в разных регионах России, но чаще всего — в Поволжье и на юге страны. Это косвенно подтверждает её народное, а не дворянское происхождение: в среде крестьян и посадских людей такие «усечённые» фамилии были обычным делом. Суффикс -ов указывает на принадлежность к определённому роду, и потомки человека по имени Манан со временем закрепили за собой фамилию Манановы.