Фамилия Мананкова — одна из тех, где за простым звучанием скрывается сразу несколько версий происхождения, и ни одну из них нельзя отбросить с порога. Самая распространённая и лингвистически обоснованная гипотеза ведёт род к каноническому мужскому имени Иммануил. В переводе с древнееврейского оно означает «с нами Бог». В русской народной среде это имя, слишком длинное и книжное для повседневного обихода, подверглось сильному сокращению. Так появились просторечные формы — Мана, Маня и, в частности, Мананка. Именно от неё и пошла фамилия. Суффикс -к- в данном случае — уменьшительный, характерный для бытовых, «домашних» имён. Следовательно, основатель рода Мананковых, скорее всего, был человеком из рабочей или крестьянской среды, где такие сокращения были нормой.

Менее вероятна, но всё же заслуживает внимания версия о прозвище Мананка. Здесь корень лежит в названии манной крупы. Мананкой могли прозвать человека, занятого её изготовлением — размолом пшеницы на особо мелкую фракцию. Такое прозвище относится к разряду «профессиональных» имён, которые давали по роду занятий. Однако эта гипотеза слабее первой: прозвища от названий продуктов в русской традиции встречаются реже, чем сокращённые формы имён.

Есть и третья версия, совсем экзотическая, но с ней стоит быть осторожнее. Некоторые исследователи проводят параллель с мусульманским мужским именем Маннан, что с арабского переводится как «милостивый». Но для фамилии Мананкова, типично славянской по своему суффиксу -ов- (принадлежность, «чей?»), такое происхождение маловероятно и могло бы возникнуть лишь в случае длительного межэтнического контакта.

Какую бы из гипотез вы ни приняли за основную, механизм образования фамилии един: к основе Мананка добавился патронимический суффикс -ов, а окончание -а указывает на женскую форму фамилии. Изначально это было отчество: «Мананкова дочь» или «Мананкова жена». Потомок человека по имени или прозвищу Мананка со временем закрепил за своим родом фамилию Мананковы.