Фамилия Манике — редкая для русского уха, и её происхождение лежит не в славянской, а скорее в тюркской или иранской языковой среде. В русском контексте она почти наверняка является вариантом фамилии Маников, записанным в упрощённой или искажённой форме. Основа здесь — личное имя или прозвище Маник, которое могло иметь два разных источника.

Первый и самый вероятный путь — из тюркских языков, где слово «маник» или «манык» означало «котёнок» или детёныша животного. Такое прозвище могли дать ласковому, пушистому или шаловливому человеку. Второй вариант — через персидское «мани» (смысл, значение) или «маник» (жемчуг, бисер). В этом случае прозвище могло получить человек, занимавшийся мелкой торговлей украшениями, либо тот, кого ценили как «драгоценного». Оба корня встречаются в антропонимии народов Поволжья и Средней Азии.

Суффикс -е в фамилии Манике — необычный для русского словообразования. В классической русской модели фамилия заканчивалась бы на -ов (Маников) или -ин (Маникин). Форма Манике характерна для фамилий, которые зафиксированы в документах «как есть», без русификации: возможно, носитель или его предки были выходцами из татарской, башкирской или казахской среды, где фамилии нередко оканчиваются на гласный. Встречается также вариант Маника — с ударением на второй слог.

В исторических записях фамилия Манике почти не попадается, что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, предки носителя этой фамилии жили в районах смешанного тюрко-славянского населения: на юге Урала, в Оренбуржье или в Нижнем Поволжье. Если же фамилия исконно русская, то её основа могла быть заимствована через какое-то местное диалектное слово, но такая версия слабее: ни в одном из словарей русских говоров «маник» в значении прозвища не зафиксирован.

Таким образом, фамилия Манике — скорее всего, осколок тюркского прозвища, которое не стали переделывать на русский лад. Её обладатель может с большой вероятностью вести род от татар, башкир или казахов, принявших православие или просто осевших в русской среде.