Фамилия Маникин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Маника восходит к аналогичному диалектному слову. Маникой в старину называли деревянную планку, прикрепленную к ручке садовых ножниц. Согласно этому, такое прозвище мог получить высокий и худой человек. По другой версии, это прозвище относится к числу так называемых "профессиональных" именований, которые указывали на род деятельности предка. Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Маникиних был садовником. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Маника, со временем получил фамилию Маникин. О точном месте и времени возникновения фамилии Маникин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Маникин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.