Фамилия Маннькова — редкий случай, когда написание вводит в заблуждение. Двойное «н» и мягкий знак перед суффиксом создают впечатление, что перед нами фамилия с корнем, оканчивающимся на мягкий согласный, но на самом деле это орфографический казус. В русской ономастике фамилии на -ов/-ев образуются от основ на твердый согласный, а мягкий знак в середине — почти всегда результат искажения при записи. Скорее всего, исходная форма — Маньков, где корень Маньк- (от имени или прозвища Манька, уменьшительного от Мануил, Иммануил, а в ряде говоров — от Матвей через форму Матюха). Мягкий знак в фамилии Маннькова, вероятно, появился из-за того, что переписчик или канцелярист «на слух» передал мягкость звука «н», а двойное «н» — случайная описка или попытка подчеркнуть произношение.

Если отбросить искажения, основа фамилии восходит к каноническому имени Мануил (древнееврейское «с нами Бог»). В народной среде это имя давали редко, чаще в монашестве, но уменьшительная форма Манька бытовала и в крестьянской среде, особенно на Русском Севере и в Поволжье. Вторая версия — связь с прозвищем Манька, которое в диалектах означало «маленький, невзрачный человек» или, наоборот, «ласковый, ручной» (от глагола «манить»). В этом случае фамилия образована не от крестильного имени, а от мирского прозвища, что для русских фамилий не редкость.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Манньков — сын Маннька (читай Манька). Фамилия фиксируется в основном в центральных и северных областях России, но из-за редкости точная география размыта. Встречаются варианты Маньков, Манков, Манькова — написание с двойной «н» и мягким знаком почти наверняка уникально для конкретной ветви рода, зафиксированной в метрических книгах XIX века. Если ваши предки носили фамилию Маннькова, ищите их в архивах под формой Маньков — так вы не пропустите родственников, чью фамилию записали без искажений.