Фамилия Мануков — классический пример того, как армянское родовое имя обрело русское «лицо». Её основа — мужское имя Манук, которое в переводе с армянского означает «мудрый». В армянской традиции имя образовывало фамилии с суффиксом -ян (Манукян), но здесь мы видим суффикс -ов. Эта замена — не случайность, а прямое указание на то, что фамилия формировалась в русскоязычной среде: при переписях, в документах или при переселении армянских родов на территорию Российской империи окончание адаптировали под местные стандарты.

Существует и менее вероятная, но любопытная версия, связывающая имя Манук с библейским Иммануилом («с нами Бог»). Согласно ей, долгий путь трансформации выглядел так: Иммануил → Мунуйло → Манук. Однако прямых лингвистических доказательств этой цепочки нет, и большинство ономастов склоняются к прямому армянскому корню.

Как и любая фамилия с таким формантом, Мануков первоначально означала «из рода Манука» или «принадлежащий к клану Манука». Само слово «азганун» (родовое имя) в армянском языке как раз и обозначает такую клановую принадлежность. Таким образом, фамилия несёт двойной культурный код: армянскую мудрость в основе и русскую форму, закрепившуюся в исторических реалиях.