Фамилия Манушакян — типичный пример армянской фамилии, образованной по патронимической модели. Она происходит от личного имени Манушак, которое в свою очередь восходит к армянскому слову «манушак» — «фиалка». Таким образом, основа фамилии — цветочное имя, которое могли дать ребенку как ласковое, поэтическое прозвище или как пожелание красоты и нежности. Армянский патронимический суффикс -ян (в старой орфографии -янц) означает «принадлежащий к роду» или «потомок», то есть Манушакян — это «потомок Манушака».

Интересно, что в отличие от русских фамилий, где суффикс указывает на отца (-ович, -ов), армянский -ян может относиться как к отцу, так и к более дальнему предку, основателю рода. Поэтому Манушакян — это не обязательно «сын Манушака», а скорее «из рода Манушака». В армянской ономастике цветочные имена в основе фамилий встречаются, но реже, чем имена, связанные с профессиями или географическими названиями. Фиалка (манушак) — один из немногих устойчивых «растительных» антропонимов в армянской традиции.

Географически фамилия Манушакян распространена по всей Армении, но исторически может быть привязана к регионам с развитой традицией использования цветочных личных имен — например, к областям Сюник или Арарат. В диаспоре фамилия встречается в России, США, Франции и Ливане, где сохраняется исходное написание.

Стоит отметить, что написание фамилии в русском языке стабильно: Манушакян, без вариантов через «а» или «о» в первом слоге. Это отличает её от фамилий, которые при русификации меняли окончание на -ов (Манушаков), но армянская форма -ян сохранилась без изменений. В дореволюционных записях можно встретить вариант Манушакянц, с сохранением старого суффикса -янц, но в советский период форма упростилась до современной.