Фамилия Манушко звучит по-украински или по-польски, и её происхождение напрямую связано с уменьшительно-ласкательной формой личного имени. Основа здесь — корень «Ман-», который восходит к крестильному имени Мануил (от древнееврейского Иммануил — «с нами Бог»). В просторечии имя Мануил сокращали до Ман, Маня, Манько, а суффикс «-ушко» — типичный для украинской и белорусской антропонимии уменьшительный показатель. Получается, что Манушко — это «маленький Ман» или «сын Мана», то есть отчество-прозвище, закрепившееся за родом.

Интересна география фамилии. Она встречается преимущественно на западе Украины — в Волынской, Ровенской, Львовской областях, а также в соседних районах Польши. Это не случайно: суффикс «-ушко» характерен именно для западных украинских говоров, тогда как на востоке Украины чаще использовали суффикс «-енко». В польском языке аналогичная модель дала фамилии вроде Манушкевич, но форма Манушко осталась более украинской. Если предки носили такую фамилию, они, скорее всего, были крестьянами или мещанами — в дворянской среде подобные «простые» уменьшительные формы не приживались.

Есть и вторая, менее вероятная версия: прозвище могло произойти от глагола «манити» (манить, обманывать). В диалектах «манушка» или «мануха» — льстец, хитрец. Но эта гипотеза слабая: суффикс «-ушко» редко крепится к глагольным основам, и для прозвища по характеру скорее использовали бы форму Мануйло или Мануля. Поэтому основной остаётся версия от имени Мануил.

Сравните с однокоренными фамилиями: Мануйлов, Мануилов, Манько, Манюк. Манушко стоит особняком — редкий суффикс указывает на конкретную местность и на то, что фамилия не проходила через канцелярскую русификацию (в России её превратили бы в Манушкина). Так что Манушко — живой диалектный след, который сохранил звучание, близкое к тому, как называли человека в быту.