Фамилия Манюх — одна из тех, что не вписывается в стандартные модели на -ов/-ин или -ский. Её основа — краткая форма имени, а окончание -юх указывает на украинское или белорусское происхождение. В восточнославянской ономастике суффикс -юх (как в фамилиях Костюх, Валюх, Павлюх) образует патронимы — фамилии по отцу. Так, Манюх — это «сын Мани», где Маня выступает как уменьшительная форма от распространённого имени Мануил (греч. Emmanuel — «с нами Бог») или реже от Иммануил. В народной среде имя Мануил давали без привязки к библейскому контексту, просто как одно из крестильных имён.

Вероятно, предок носителя фамилии был Маня — так в быту звали Мануила. От этого прозвища и пошла фамилия: сначала Манюх (буквально «маленький Маня» или «сын Мани»), а затем она закрепилась за родом. В польском и украинском языках суффикс -юх мог также нести ласкательный или пренебрежительный оттенок, но в фамилиях он чаще всего просто указывал на родство.

Географически фамилия Манюх тяготеет к западнорусским землям — историческим территориям Украины, Беларуси и приграничным областям России (Смоленщина, Брянщина). Встречается она нечасто, что типично для фамилий на -юх: они не получили массового распространения, как, например, фамилии на -ов, но сохранили локальную привязку. Например, в документах XVIII–XIX веков можно найти крестьян и мещан с такой фамилией в Черниговской и Могилёвской губерниях. Сословно носители Манюх, скорее всего, были из простых людей — крестьян или ремесленников, без дворянских корней.

Есть и более редкая версия: основа могла быть не от имени, а от прозвища Манюха, связанного с глаголом «манить» (звать, обманывать) или диалектным «манюха» — так в некоторых говорах называли медлительного или вялого человека. Но эта гипотеза слабее: суффикс -юх в фамилиях почти всегда указывает на отчество, а не на личное качество. Поэтому основная и самая правдоподобная версия — фамилия Манюх ведёт род от человека по имени Мануил.